Un método creado recientemente llamado "perfil de proteínas" emplea espectrometría de masas para identificar la variedad o los tipos de uva en el jugo o el vino sin clarificar. La proteína que se produce en las uvas después del envero sirve para distinguir variedades. Estas proteínas son relativamente estables en el jugo y el vino, a diferencia del ADN.
Investigación por el Instituto Australiano de Investigación del Vino sobre las proteínas formadoras de turbidez ha dado lugar a esta herramienta potencialmente útil para comprobar la integridad varietal del zumo y el vino comprados, siempre que las proteínas no se hayan eliminado mediante la clarificación. Para uvas con piel clara, el método tiene un sólido historial, pero se requiere más investigación para uvas con piel oscura. El análisis aún no es viable para su uso diario en la báscula puente, ya que requiere equipos complejos y personal especializado.
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