Une méthode récemment créée appelée « profilage des protéines » utilise la spectrométrie de masse pour identifier le cépage ou les types de raisins dans le jus ou le vin non raffiné. La protéine produite dans les raisins après la véraison sert à distinguer les variétés. Ces protéines sont relativement stables dans le jus et le vin, contrairement à l'ADN.
Recherche par le Institut australien de recherche sur le vin sur les protéines formant un trouble a conduit à cet outil potentiellement utile pour vérifier l'intégrité variétale des jus et vins achetés, tant que les protéines n'ont pas été éliminées par collage. Pour les raisins à peau claire, la méthode a fait ses preuves, mais des recherches supplémentaires sont nécessaires pour les raisins à peau foncée. L'analyse n'est pas encore viable pour une utilisation quotidienne au pont-bascule car elle nécessite un équipement complexe et du personnel spécialisé.
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