最近创建的一种称为“蛋白质分析”的方法采用质谱法来确定未精制果汁或葡萄酒中的葡萄品种或类型。转色后葡萄中产生的蛋白质有助于区分品种。与 DNA 不同，这些蛋白质在果汁和葡萄酒中相对稳定。
研究由 澳大利亚葡萄酒研究所 对形成浑浊的蛋白质的研究催生了这种潜在有用的工具，用于检查购买的果汁和葡萄酒的品种完整性，只要这些蛋白质没有通过澄清去除。对于浅色皮的葡萄，该方法具有良好的记录，但对于深色皮的葡萄需要更多的研究。该分析尚不能在地磅日常使用，因为它需要复杂的设备和专业人员。
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